DSP空间转录组,DSP病理标致

DSP空间转录组,DSP病理标致

这一篇继续回顾一下cell2location,使用我们推荐用于基于探针的空间转录组学数据的cell2location 方法的一个版本，将胎儿脑细胞类型映射到使用NanostringWTA(就是DSP) 技术分析的非因DSP空间全转录组（Whole Transcriptome Atlas, WTA）可在单张石蜡包埋（FFPE）组织切片或者新鲜冷冻切片上实现原位检测人类（18000多个蛋白编码基因）和小鼠（21000多个蛋白编

新皮质是进化程度较高级的皮质，占据哺乳动物大脑皮质的大部分，与一些高等功能如知觉、运动指令的产生、空间推理、意识及人类语言关联密切。近期，剑桥大学Sanger研究所在bioRxiv该研究利用最新的DSP（Digital Spatial Profiler）数字化空间多组学分析技术获得了正常结肠组织的空间表达谱数据，结合癌变结肠组织的空间转录组数据，逐步剖析了CRC恶性转化过程中

(=｀′=) 该研究利用数字化空间全转录组技术（DSP-WTA）对44例非小细胞肺癌患者的原发性和转移性肿瘤标本不同区域进行空间全转录组研究，研究表明，大脑中的肿瘤微环境(TME)，包括TIME和TBMEDSP空间转录组可以自定义圈选组织位置检测转录组或蛋白质测序，检测的组织面积是14.6mm*36.2mm,支持的送样类型更多；10x Visium 空间转录组对整张组织切片无偏检测转录组表达水平，可检测组织面积6.5

o(?""?o 该研究综合应用单细胞测序技术和DSP空间转录组技术全面构建了新冠患者的肺、肝、肠等各个器官组织的单细胞图谱以及空间图谱，并分析了其基因表达特征。image 研究思路image 图1:研究思路image DSP空间转录组是具备细胞分辨率可获取组织空间图谱的新技术，DSP空间转录组中的全转录组图谱( W TA )产品包含了人类或者小鼠18000+基因，可用于原位检测人类或者小鼠全转录组表达量分

(IF=10.9)杂志上的文章，该研究利用NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler (GeoMx DSP)空间多组学平台分析aNSCLC患者不同空间位置和不同疗效组的转录组和蛋白质组信息，发现跟双2. GeoMx DSP数字化空间蛋白质组的应用方向2.1肿瘤微环境研究2.2肿瘤免疫治疗及药物靶向治疗研究2.3肿瘤异质性研究2.4生物标记物探索与验证2.5转录组与蛋白质组共分析2.6免疫学机理研究