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羟甲基化测序,羟甲基化树脂

5mc甲基化 2023-12-30 14:17 376 墨鱼
5mc甲基化

羟甲基化测序,羟甲基化树脂

目前,DNA甲基化和羟甲基化分析测序行业的黄金标准是亚硫酸氢盐测序【5-6】及其衍生方法:TET辅助亚硫酸氢盐测序(TET-assisted bisulfite sequencing, TAB-Seq)【7】和氧化亚硫酸氢盐随着研究的深入,发现之前被认为是检测DNA甲基化标准的重亚硫酸盐测序并不能区分DNA甲基化(5mC)和DNA羟甲基化(5hmC)。易基因联合剑桥大学建立了化学氧化法结合重亚硫酸盐转化的测序

一、羟甲基化检测

重亚硫酸盐转化测序可通过靶向方法完成,如扩增子甲基化测序(Methyl-seq),或全基因组重亚硫酸盐测序(WGBS)。此外,TAB-Seq和OxBS等替代方法也利用NGS来鉴定羟甲基化(5-hmC)并开展甲基化(5-mc)分析。本研究利用RRBS+oxRRBS技术鉴定牦牛和牛的大脑、脑干、小脑、下丘脑的基因组5mC和5hmC位点,绘制全基因组DNA甲基化和羟甲基化图谱,并进行DNA甲基化/羟甲基化差异化分析和对应转录组

二、羟基甲基化方法

∩△∩ 特异性检测羟甲基化:5-hmC 抗体能够区分甲基化和羟甲基化信号,特异性的检测羟甲基化区域。灵活度高:能够直接对任意物种的高羟甲基化片段进行测序,无需已知的基因组序列信息。检测范围广:覆盖整高性能、快速、集成的工作流程,适用于人类全基因组测序等灵敏应用寻找合适的试剂盒软件和分析BaseSpace 序列中心BaseSpace 应用程序DRAGEN Bio-IT 平台TruSight 软件套组BaseSpace 变异解

三、dna羟甲基化

图5. 胃ai及肠ai的ctDNA羟甲基化检出率很高在线留言我已阅读并同意《隐私保护》提交环状RNA测序m1A-MAP 全转录组测序RIP测序m6A全转录组测序图1.oxBS-seq 5mC单碱基分辨率测序(Booth, M. J. et al.2012, Science)二、TET辅助的重亚硫酸盐测序(TAB-seq)用糖基把羟甲基化的C给保护起来,然后用TET蛋白(Ten-eleven transloc

四、羟甲基化反应

∪▽∪ 可广泛应用于羟甲基化与疾病关系研究以及羟甲基化在胚胎发育过程中的研究。核心技术及质控,用心服务每一个项目专注表观组学10年,提供专业有价值的DNA羟甲基化完整解决方案;甲基化(研究新热点)是表观遗传(Epigenetics)调控的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要的作用。Aksomics(原康成生物)为您提

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