lncrna研究技术路线图,lincrna和lncrna

lncrna研究技术路线图,lincrna和lncrna

1.测序知道lncRNA的染色质位点2.lncRNA的二级结构确定3.lncRNA上的蛋白结合位点的确定4.lncRNA的过表达、敲减→临近基因转录是否改变？5.如果lncRNA临近基因转录改变→PolyA信一旦确定想研究的某个lncRNA,理解这个lncRNA功能的第一步就是弄清楚它在局部顺式(in cis)调控基因表达，还是它离开转录位点并反式(in trans)方式发挥功能。辨别lncRNA是顺式调控，还

同时对非编码RNA(lncRNA、circRNA)的功能、下游靶基因进行研究，揭示其具体作用机制，有助于理解肿瘤发生发展、转移、耐药中的基因表达及调控机制。二、技术路线图2.1 lncRNA研究为了探究sno-lncRNA的功能，研究者使用RNAi的技术敲低了这5个sno-lncRNA,发现与神经发育等相关的基因发生了可变剪切(图3.1)。通过分析CLIP-seq数据，发现5个sno-lncRNA均与剪切因子FO

技术路线图：下面我们来看文章的具体内容：1. 作者从GEO数据库下载原始芯片数据进行分析，通过胃癌RNA表达谱分析发现HOXC-AS3明显高表达，为了验证这个结果，又对TCGA数据库中分析胃癌lncrna研究思路机制主要分为三大步骤：lncrna研究思路机制1、lncRNA的筛选基于链特异性建库的RNA-seq能够对不同组织或样本的lncRNA进行测序，通过对转录本编码

技术路线本研究技术路线如图所示。结果解析01、评估IDElncRNA的准确性和可靠性IDElncRNA 配置文件中包含3,458 个lncRNA,五重验证测试的平均准确度在样本和lncRNA 水平均高于技术路线图：结果：1.lncRNA INCR1在IFNγ刺激的肿瘤细胞中表达首先对IFNγ刺激的患者源性GBM细胞株(PDGCLs)进行了全转录组分析(RNA测序，Figure 1A),IFNγ刺

≥ω≤ CDKN1B表达过表达/敲低miR-455-5p检测CDKN1B表达AGO2-RIP/RNA pull down验证结合分析lncRNA Gas5表达量与miR-455-5p及CDKN1B表达的相关性lincRNA Gas5/miR-445-5p/CDKN1B通路基于上述预实验研究结果，研究人员提出如下科学假说：低甲基化水平促进lncRNA HUMT的高表达，HUMT与结合蛋白YBX1形成转录复合物作用于FOXK1启动子区，上调FOXK1的表达进而激活下游通路，