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如何用ncbi比对序列 |
如何用ncbi查基因的同源序列,怎么找一个基因的同源基因
套路1 进入NCBI网站,在Nucleotide(核苷酸)数据库中搜索,以人CCL2为例。在结果界面的右侧,Table of contents下,选择NCBIReference Sequences(RefSeq)跳转至相应1.基于NCBI HomoloGene数据库查找物种间对应的同源基因NCBI HomoloGene数据库收集了部分已经完成基因组测序物种的同源基因数据。数据库现包含21个物种,共44233组同源基因;Homolo
database)来实现的。概括地说,就是利用相对易获取、或已知的信息,如基因名或基因ID,关联到与之对应的RefSeq序列接收号,从而get目标序列信息。具体操作步骤如下:01、进入NCBI网站:进入https://ww这篇可能对做分子的同学有帮助哦~ 如何使用ncbi快速找到同源很简单易上手一学就会!妈妈再也不用担心我眼睛会了手没会了@生活薯@日常薯
(1)在NCBI的核酸(或蛋白)数据库中查询;(2)借助基因组注释文件,在全基因组序列中获得(包含两种方式,过程不同但结果一致); (3)通过blast查找获得(又分为在线blast和本地blast)。已将下述内容简要NCBI的在线BLAST:http://blast.ncbi.nlm.nih/Blast.cgi 下面是具体操作方法1,进入在线BLAST界面,可以选择blast特定的物种(如人,小鼠,水稻等),也可以选择blast所有的核酸或蛋白序列。不同的bl
╯^╰ ncbi如何使用NCBI在线BLAST用法详解首先进行Blast类型的选择blastp:将待查询的蛋白质序列及其互补序列一起对蛋白质序列数据库进行查询blastn:将待查询的核酸序列及其互补序列一1、直接通过浏览器搜索ncbi,选择对应网站跳转。2、这个时候弹出新的窗口,需要根据实际情况搜索相关信息。3、下一
是将基因列表输入到Filters里,具体操作是先点击左边的Filters,然后再点击右边的GENE, 之后勾选中Input external references ID list,最后在右边输入栏里输入基因ID,或者导入基因ID把这个一个拟南芥的序列与这个数据库进行比较,查看那些物种的序列和这个序列相似,这个是线上的方法,我们直接利用ncbi中的官网的方法比较blast,也可以使用一种本地的方法,就是在集群
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标签: 怎么找一个基因的同源基因
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