SSR标记哪些是新开发的,新标记已收集 空标记

SSR标记哪些是新开发的,新标记已收集 空标记

最近，研究人员开发了一款新的软件包GMATA,它通过映射和图形化的方式为快速SSR分析、标记开发和多态性筛选提供了新的策略和全面的解决方案，并将结果显示在具有其他基因特征的基因组浏览器中。此外，该研究报道了一个新开发的生物信息学工具SSR2Marker。SSR2Marker可用于鉴定任何两组序列间潜在的SSR分子标记及其多态性特征。利用已有的高质量基因组序列，SSR2marker具有两方面的显

SSRome作为一个基于web的、用户友好的、全面和动态的数据库，提供了多种组学数据的分析管道，目前可以用于6533种生物的SSR标记开发。在SSRome数据库中，包含从NC1.花生EST-SSR 分子标记的开发[J], 王金彦；潘丽娟；杨庆利；禹山林2.花生EST-SSR 分子标记的开发[J], 王金彦；潘丽娟；杨庆利；禹山林3.花生SSR 标记的开发及其应用现状和

≥▽≤ 然而，杉木尚无全基因组序列信息，杉木ssr标记开发滞后，目前仅开发出少量ssr引物，分子标记数量不足，限制了杉木分子遗传学研究。技术实现要素：基于此，本发明的目一种高粱重测序数据开发的ssr核心标记方法技术领域1.本发明涉及分子生物技术领域，具体为一种高粱重测序数据开发的ssr核心标记方法。背景技术：2.高粱是禾本

SSR(又称STR)作为第二代分子标记技术，成本低、检测结果准确且开发并应用的较早。很多基于SSR检测物种品种的方法已经被试验流程化、标准化，在全国各检测机构被广泛应用，例如通过使用SSR分子标记开发产品概述简单重复序列(Simple Sequence Repeats,SSR),在各种真核生物基因组中，分布广且比较均匀。通过对样本基因组中SSR标记等DNA多态性的分析，可以得到样本DNA序

通过高通量测序进行的微卫星标记开发方法主要有：1)基因组测序(genomic SSR);(2)转录组测序(EST-SSR);(3)SSR文库富集测序。本文列举了几种常用的基于高通量测序的微卫星DNA开发方法及相应的文章解为了建立基因组和细胞器子数据库，设计了六个主要步骤：i)在基因组规模上挖掘SSR;(ii)根据基序位置将SSR分为基因型或非基因型；iii)进一步细分为唯一型和复合型SSR;(iv) SSR引物设计和标记开发；v)