ssr标记只有两个条带,多重比较字母标记法ssr

ssr协议 2022-12-19 11:28 357 墨鱼

ssr协议

ssr标记只有两个条带,多重比较字母标记法ssr

根据各SSR标记在相同分子量片段的有无，统计得到所有位点的二元数据，有DNA扩增带记为1,无带记为0,将各材料的SSR条带，转换成“0,1”矩阵后，采用POPGENE软件计算出平均等位基因数(Na)、有效等位基因( 6) PCR 反应的退火温度应根据不同的引物来确定最佳退火温度，以确保扩增的条带中杂带少，目标带明显，引物退火温度一般按照Tm = 4 ℃( G + C) + 2 ℃( A + T)

SSR的原理从英文名称来解释就可以了，Simple Sequence Repeats 简单重复序列，一类由几个核苷酸(一般为1~说明引物特异性不是很好，扩增的杂带较多，条带少的话，一般用genemarker或者popgene来处理，方法可以在网上查到的，我最近也才做完SSR，反正我是这么读条带的，我

＼　＿　／回答：有不同读带方法，你用什么软件分析？1 条带的多少要看你检测的位点数目，如果你检测单一位点的话，只会在具有不同多态的个体中检测到大小不同的两个条带，如果是多个位点的话，会产生多个条带.2 多态

1 条带的多少要看你检测的位点数目，如果你检测单一位点的话，只会在具有不同多态的个体中检测到大小不同的两个条带，如果是多个位点的话，会产生多个条带. 2 多态性需pcr产物经过2.5%琼脂糖凝胶电泳初步筛选，之后用全自动毛细管电泳仪qiaxcel advanced(德国qiagen生物公司)验证，最终获得20对条带清晰、多态性高、重复性好的ssr标记引物。0022] 【

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