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DNA甲基化测序 |
DNA甲基化的检测方法,DNA羟甲基化
∪﹏∪ (一)基于MIP引物的检测方法01、直接测序法这种方法一度被认为是DNA甲基化分析的金标准。过程:经过亚硫酸氢盐处理后,用PCR扩增目的片段,并对PCR产物进行测序,将序列与未经处理的序一、甲基化分型检测(二)基于msp引物的检测方法1甲基化特异性pcr (ms-pcr) 这种方法经济实惠,无需特殊仪器,目前应用最广。它将dna先用重亚硫酸盐处理,这样未甲
在传统的MSP⽅法中,通常设计两对引物,⼀对MSP引物扩增经亚硫酸氢盐处理后的DNA模板,⽽另⼀对扩增未甲基化⽚段。若第⼀对引物能扩增出⽚段,则说明该检测位点存在甲基化,为一种采用甲基化DNA富集与高通量测序技术相结合的DNA甲基化检测方法。主要通过特异性结合甲基化DNA的蛋白MBD2b去富集高甲基化的DNA片段,然后结合高通量测序
然而,诸如胞嘧啶的甲基化修饰及其分布,组蛋白的乙酰化等,同样影响着表型。这就构成了表观遗传学(epigenetics)的主要研究内容。其实,早在1942年,C.H.Waddinton就提出了表观遗DNA甲基化测序方法按原理可以分成三大类:1、重亚硫酸盐测序;2、基于限制性内切酶的测序;3、靶向富集
ˇ^ˇ 3.LUMA (luminometric methylation assay):也是在⽂献中经常见到的⼀个检测整体DNA甲基化的⽅法。它是通过焦磷酸测序,检测甲基化敏感与不敏感的两种限制性内切酶对DNA的酶切1、基因组整体水平甲基化分析a) 高效液相色谱柱(HPLC)及相关方法b) SssI 甲基转移酶法c) 免疫化学法d) 氯乙醛法2、动物血清elisa试剂盒特异性位点的DNA
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标签: DNA羟甲基化
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